能一下子就除掉，必须慢慢来。
刚登基的时候，崇祯对魏忠贤还是和往常一样客气，甚至还赏了他一些金银珠宝。魏忠贤以为崇祯和熹宗一样好控制，还是像以前那样专权，甚至想把自己的侄女送进后宫，继续和皇室攀关系。可他没注意到，崇祯已经在暗中布局了——他先是以“奉圣夫人不宜留宫”为由，把客氏赶出宫去，切断了魏忠贤在后宫的眼线；然后又提拔了一些反对阉党的官员，让他们慢慢掌握权力。
天启七年十一月，首先发难的是云南道御史杨维垣，他上了一封奏折，弹劾魏忠贤的党羽崔呈秀。崇祯借着这个机会，下令免去崔呈秀的官职，把他赶回了老家。崔呈秀是魏忠贤最得力的助手，他的倒台，让阉党开始恐慌。紧接着，更多的官员站了出来，弹劾魏忠贤的罪状，有的甚至把当年杨涟的《劾魏忠贤二十四大罪疏》重新递了上来，连“与客氏私通”的旧账也翻了出来。
魏忠贤这才意识到，崇祯不是熹宗，他这次是真的要对自己下手了。他想故技重施，跑到崇祯面前哭求，可崇祯只是冷冷地看着他，说：“你在宫里待了这么久，也该歇歇了，回老家去吧。”
天启七年十一月初，魏忠贤带着几十个随从，离开了他待了二十多年的紫禁城。他坐在马车上，看着路边的风景，心里五味杂陈——他想起自己当年从肃宁来北京时，只是个一无所有的赌徒；靠着自阉入宫、攀附客氏，他成了权倾朝野的“九千岁”，可如今，那些生祠、那些党羽、那些“九千九百岁”的称呼，都成了过眼云烟。走到河北阜城时，他收到了崇祯的圣旨——圣旨里列举了他的种种罪状，从“擅权乱政”到“秽乱宫闱”，最后下令把他抓回北京，严加审讯。
魏忠贤拿着圣旨，手不停地发抖。他知道，自己一旦被抓回北京，等待他的肯定是凌迟处死。当天晚上，他住在阜城的一家客栈里，想起了客氏——听说客氏被赶出宫后，已经被崇祯下令打死了；想起了那些被他害死的东林党人，杨涟、左光斗他们的冤魂，仿佛就在眼前。他从包袱里拿出一根绳子，挂在房梁上，随着一声闷响，魏忠贤的身体悬在了半空中。这个曾经让整个大明王朝为之颤抖的权宦，最终以自缢的方式结束了自己的一生。他死后，崇祯下令磔其尸，查抄他的家产，结果抄出了白银两千多万两、黄金百万两，还有无数的珍宝——这些财富，都是他从百姓身上刮来的，从大明的国库里偷来的。
崇祯还下令拆毁全国各地的魏忠贤生祠，把魏忠贤的党羽一个个抓起来处死或流放，史称“钦定逆案”。