只得默许。
本始二年（前72年）正月，刘询正式册立许平君为皇后，按照汉朝惯例，皇后之父应被封侯。可霍光却以许广汉“受宫刑，非正常人”为由，反对封其为侯，刘询虽为帝王，却受制于霍光，只得先封许广汉为昌成君，待日后再作打算。许平君对此毫不在意，她对刘询说：“我不在乎父亲是否封侯，只愿我们母子能常伴你左右。”
成为皇后的许平君，并未因身份的提升而变得骄纵。她依旧保持着民间生活的简朴，后宫用度皆从简，对宫中嫔妃、宫人也多有体恤——有宫女犯错，她从不苛责，而是问清缘由后从轻发落；嫔妃生病，她会亲自前去探望，送去汤药。后宫在她的治理下，秩序井然，无争宠构陷之事，刘询得以专心处理朝政，对她愈发敬重与疼爱。
许平君的皇后之位，成了霍光之妻霍显的心头刺。霍显一心想让女儿霍成君成为皇后，见许平君深得刘询宠爱，又在后宫中威望日高，心中妒恨渐生，竟生出了毒杀许平君的歹念。
本始三年（前71年），许平君再次怀孕，足月后生下一名公主。产后的许平君身体虚弱，需要太医调理。霍显得知后，找到了与自己素有往来的女医淳于衍——淳于衍的丈夫是掖庭户卫，一直想调任安池监，霍显便以此为诱饵，对淳于衍说：“你的丈夫本就应当担任安池监这一官职，凭他的能力完全能得到这个职位。我听说凡是有妇女在生产或哺乳期间患病，只要三天内病情发作，在药里加进附子，病人吃了马上就会死亡，而且没人会知道其中的缘故。现在皇后即将分娩，可以趁机在她的药里下毒除掉她。如果能得到您的帮助，事情成功以后，荣华富贵我会和你一同分享。”
淳于衍初时惊惧，深知毒杀皇后是灭族之罪，可又抵不住霍显的威逼利诱——霍显不仅承诺帮她丈夫调任，还以“若不从，君一家性命难保”相威胁。最终，淳于衍答应了霍显的要求，将附子研磨成粉，藏在药中。
许平君服用汤药后，很快便出现不适，她虚弱地对身边的宫女说：“我头好晕，药中莫非有毒？”话音刚落，便气绝身亡，年仅21岁。
许平君突然离世，刘询悲痛欲绝，他看着妻子冰冷的遗体，心中疑窦丛生——许平君产后虽虚弱，却无大病，怎会服药后突然暴毙？他当即下令将为许平君诊治的太医、宫女全部收押，彻查此事。淳于衍因神色慌张，被列为重点怀疑对象，很快便被投入大牢。
霍显得知淳于衍被抓，害怕事情败露，只得将自己指使淳于衍毒杀许平君的实情告知霍光。霍光听闻后，大惊失色，他既怒霍显的胆大妄为，又怕此事牵连霍氏家族，犹豫再三后，最终选择了掩盖真相——他入宫面见刘询，以“皇后产后体虚，偶发急病而亡”为由，请求刘询赦免淳于衍，又暗中施压负责查案的官员，让他们草草结案。
刘询虽心中不信，却深知霍光权倾朝野——此时霍光掌控着朝政、兵权，自己刚即位不久，根基未稳，若强行追查，不仅可能查不出真相，还会危及自身与太子刘奭的安全。他强压下心中的悲痛与怒火，默许了霍光的请求，下诏释放淳于衍，对外宣称许平君“产后崩”（《汉书·宣帝纪》），追谥其为“恭哀皇后”，葬于杜陵南园（今陕西西安东南）。
许平君下葬那日，刘询亲自送葬，站在墓前，他望着新立的墓碑，泪水无声滑落。他在心中暗暗发誓：“平君，今日之辱，今日之痛，我必铭记于心，他日定要为你报仇，让害你的人血债血偿！”
许平君死后第二年，霍光女儿霍成君被立为皇后。霍成君骄纵奢华，与许平君的简朴截然不同——她的服饰、车马皆极尽奢靡，对宫中宫人也极为苛刻，稍有不满便加以责罚，后宫上下虽敢怒不敢言，却都暗自怀念许平君的仁厚。刘询对霍成君虽表面礼遇，心中却充满厌恶，每次与她相处，都想起许